現在的養殖模式，依然是上世紀七十年代的傳統養殖模式，即是進水+養殖池塘+排水的方式，隨著養殖規模的不斷擴大，養殖的數量的不斷增加，導致大量的投料和養殖動物的排泄物在水體中長時間積累，不僅污染了養殖池內的水，隨著排放也會嚴重影響附近水域的營養化程度。未經處理的養殖廢水含有大量懸浮物、有機污染物質以及氮、磷等營養物，直接排入附近水域不僅會導致水體富營養化，還會使部分對污染物質敏感的水生生物逐漸死亡，嚴重時水體將會發黑發臭，造成持久性有機污染。那么我們該如何提高水產養殖廢水生物處理效率呢？

生物強化技術是目前有效能夠提高水產養殖廢水生物處理效率的方法之一，它包括高效菌處理方法和固定化處理兩種方法。

高效菌，包括微生態制劑作為水產凈化劑已是水產養殖的必備，應用范圍極其廣泛。盡管改善水質的方法很多，但很多方法都有一定的缺點，不盡如人意。所以，在養殖池中施放有益微生物，讓其參與養殖池的生態循環，一方面可改善水體質量，清除有機廢物；另一方面可抑制、排斥病原微生物的繁殖生長，達到防治病害的目的。微生態制劑可有效降解有機污染物的細菌有假單胞菌、枯草芽孢桿菌、硝化細菌、多粘球菌、腸道菌群等，它們發揮氧化、氨化、硝化、反硝化、解磷、硫化、固氮等作用，將動物的排泄物、殘存飼料、浮游生物殘體等迅速分解為二氧化碳、磷酸鹽、硝酸鹽、硫酸鹽等，是物質循環流動不可缺少的部分。微生態制劑在水產養殖水質凈化中的效益是潛在的、長期的，是未來研究、發展和應用的主要方向，其前景十分廣闊。

近年來固定化微生物技術是研究比較多的污水處理技術之一，關于閉合養殖系統中固定化微生物研究也有些許報道。但目前固定化微生物脫氮主要應用于污水處理、工廠化養殖循環廢水處理的室內模擬，還沒有達到可以在養殖池塘中使用的程度，關于浮游動物對水體氮的吸收、轉換及釋放的循環機制，也需要進一步研究確定。